住宅の新築工事や大規模なリフォーム工事の届け出を受けて、建築主事に代わって建築確認や完了検査を行う機関のこと。
「民間の建築主事」とも呼ばれている。
全国的な規模で業務を行う場合は「国土交通大臣指定」を、１つの地方整備局内の複数の都道府県で業務を行う場合は「地方整備局指定」を、１つの都道府県内で業務を行う場合は「都道府県知事指定」を受けなければならない。
現在、約130の機関が指定確認検査機関として認定されている。